Alle 0612 GMT, la pagina dei risultati mostrava il conteggio dei voti come completo allo 0%, mentre in precedenza mostrava i risultati di oltre il 50% dei seggi elettorali. Le elezioni si sono svolte mercoledì.
I tecnici del centro risultati di Midrand, a nord di Johannesburg, hanno detto che stavano lavorando per risolvere il problema.
"Stiamo lavorando per ripristinare il servizio", ha detto un portavoce della commissione elettorale su un gruppo WhatsApp per i media.
"Il sistema dei risultati è ancora operativo e gli uffici locali continuano ad acquisire i risultati".