Ultima Genomics, Inc. ha presentato un'ampia collaborazione con NVIDIA che sfrutta l'analisi accelerata dall'AI in più fasi del processo di sequenziamento e analisi del DNA. La collaborazione include l'uso delle GPU NVIDIA per il deep learning nella fotometria e nella chiamata di basi e presto includerà l'accelerazione della chiamata di varianti. Negli ultimi cinque anni, Ultima Genomics ha sviluppato un'architettura di sequenziamento fondamentalmente nuova, progettata per scalare oltre gli approcci convenzionali, che comprende un'ingegneria delle cellule di flusso, una chimica di sequenziamento e un apprendimento automatico completamente diversi.

Ultima sta attualmente partecipando a un programma di accesso anticipato per UG 100™, il suo primo strumento di sequenziamento di prossima generazione ad alto rendimento che utilizza questa nuova tecnologia, che consente ai clienti di generare dati di sequenziamento di alta qualità a un costo di 1$/Gb. La genomica incontra l'AI: lo strumento Ultima utilizza le GPU NVIDIA A30 con la piattaforma di elaborazione AI NVIDIA Clara [2] per offrire analisi primarie e secondarie altamente accurate e accelerate ai clienti che desiderano eseguire analisi genomiche su scala. Ultima ha annunciato separatamente partnership per sviluppare pipeline di chiamata di varianti germinali specifiche di Ultima per DeepVariant di Google.

Questi modelli personalizzati possono essere eseguiti all'interno di NVIDIA Clara Parabricks, che accelera queste e altre applicazioni di analisi secondaria. Le pipeline computazionali di NVIDIA Clara Parabricks impiegano gli stack CUDA, HPC, AI e di analisi dei dati di NVIDIA per offrire librerie, pipeline e workflow applicativi di riferimento accelerati dalle GPU per l'analisi primaria, secondaria e terziaria. Le soluzioni off-the-shelf sono abbinate a un toolkit per supportare lo sviluppo di nuove applicazioni per rispondere alle esigenze in rapida evoluzione dei laboratori genomici high-throughput.