Toyota Motor è scivolata del 2,6% a causa delle continue conseguenze di uno scandalo di certificazione, con le azioni legate alle automobili tra i settori che hanno registrato le performance peggiori.
Il Nikkei ha chiuso la giornata in calo dell'1,8% a 38.102,44, dopo essere sceso fino al 2,2% a 37.956,49 per la prima volta dal 30 maggio.
Dei 225 componenti dell'indice, 199 sono scesi, mentre 25 sono saliti e uno è rimasto piatto.
Il più ampio Topix ha perso l'1,7%.
Quasi tutti i 33 gruppi industriali della Borsa di Tokyo sono scesi, guidati da un crollo del 3,5% per il settore immobiliare. Solo il settore farmaceutico ha registrato un leggero guadagno.
"Fondamentalmente, il Nikkei ha seguito un andamento piuttosto laterale per molto tempo, e ora è stato scosso un po' da alcune preoccupazioni sull'economia", in Giappone, negli Stati Uniti e in Europa, ha detto Kazuo Kamitani, stratega azionario di Nomura Securities, prevedendo che la correzione potrebbe arrivare fino a 37.500 dollari.
Il Nikkei ha oscillato per lo più circa 500 punti da una parte e dall'altra di 38.500 dalla fine di aprile, dopo aver toccato un picco record a 41.087,75 il 22 marzo e poi essere sceso fino a 36.733,06 un mese dopo.
Le case automobilistiche e i fornitori hanno perso il 2,6% lunedì.
L'emittente nazionale NHK ha riferito che Toyota avrebbe prolungato il blocco della produzione per i modelli interessati di almeno un altro mese, fino alla fine di luglio.
Il Presidente di Toyota e rampollo di famiglia Akio Toyoda deve affrontare un voto contrario alla sua rielezione in occasione dell'assemblea annuale degli azionisti che si terrà martedì.
Suzuki Motor è scesa del 3,6% e Mazda ha perso il 3,7%.
Anche le azioni legate ai chip si sono ritirate, con Tokyo Electron in calo del 2,5% e Advantest che ha perso il 3,7%. (Relazione di Kevin Buckland; modifica di Sonia Cheema e Subhranshu Sahu)