Oxford Nanopore e Day Zero Diagnostics hanno annunciato una collaborazione per sviluppare una soluzione end-to-end per la diagnosi delle infezioni del flusso sanguigno, una delle principali cause di sepsi. Le aziende collaboreranno per integrare e ottimizzare un sistema diagnostico da utilizzare in ambito clinico, come gli ospedali, che fornirà l'identificazione in giornata e il profilo di suscettibilità antibiotica basato sulla genomica, senza la necessità di effettuare una coltura del sangue. Le aziende prevedono di perseguire le approvazioni normative, anche con la FDA, in futuro.

Secondo l'Organizzazione Mondiale della Sanità (OMS), ogni anno si verificano 11 milioni di decessi legati alla sepsi, che rappresentano un decesso su cinque in tutto il mondo. Un trattamento precoce ed efficace è fondamentale in caso di infezione grave, perché il rischio di mortalità può aumentare di ora in ora. Tuttavia, le attuali diagnosi basate sulla coltura possono richiedere giorni per fornire un risultato, anche per quanto riguarda la suscettibilità antimicrobica.

I lunghi tempi di risposta hanno anche limitato fortemente il ruolo della diagnostica nella terapia standard, portando sia a un dannoso sovra-trattamento che a un mortale sotto-trattamento quando sono coinvolti organismi resistenti agli antibiotici. C'è un'esigenza critica di una diagnostica rapida che possa fornire i risultati dei test di identificazione dell'organismo e di suscettibilità antimicrobica in poche ore, per guidare la terapia. Il sistema diagnostico combinerà la tecnologia di preparazione dei campioni ad altissimo arricchimento di DZD e la sua pipeline di identificazione microbica e di suscettibilità agli antibiotici guidata dall'AI Keynome con le letture di sequenziamento del PromethION 2 Solo di Oxford Nanopore, ad alta produttività e di piccolo formato.

La collaborazione mira a un flusso di lavoro di elaborazione e sequenziamento dei campioni completamente automatizzato, adatto alle esigenze dei laboratori clinici ospedalieri. Le caratteristiche uniche in tempo reale e scalabili e i progressi nell'accuratezza del sequenziamento a singolo nucleotide della piattaforma Oxford Nanopore la rendono ideale per la caratterizzazione rapida ed economica dei patogeni nei campioni clinici. Oltre alla collaborazione sul sistema diagnostico, DZD ha anche firmato un accordo per offrire il sequenziamento e l'analisi basati su ONT per i clienti commerciali.

Attualmente, DZD offre una famiglia di servizi di laboratorio con il marchio epiXact, che utilizza tecnologie proprietarie per aiutare le organizzazioni sanitarie e di life science a tracciare e gestire i focolai di infezione, a caratterizzare gli organismi di interesse a scopo di ricerca e a prendere decisioni di R&S ad alto impatto. ONT sarà ora una piattaforma di sequenziamento su cui fornire questi servizi e DZD ha recentemente annunciato il lancio di epiXact ID, un servizio di rapida esecuzione che fornisce l'identificazione di un organismo ad alta risoluzione e la caratterizzazione profonda di un campione utilizzando il sequenziamento nanopore dell'intero genoma.