Singular Genomics Systems, Inc. ha presentato il sequenziatore spaziale G4X. Il G4X è stato progettato per offrire il sequenziamento diretto in situ ad alta velocità dell'RNA (Direct-Seq?), la trascrittomica mirata e la profilazione proteomica da tessuti fissati in formalina e inclusi in paraffina (FFPE). Il G4X condividerà la stessa piattaforma del sequenziatore G4® esistente e si prevede che sarà il primo strumento a duplice uso del settore, in grado di offrire sia le funzionalità tradizionali di NGS che quelle di sequenziamento spaziale basato sui tessuti.

Con l'aggiunta della multiomica ad alto rendimento e della nuova tecnologia Direct-Seq al suo portafoglio con il G4X, Singular si posiziona per diventare l'unica azienda al mondo ad offrire il sequenziamento spaziale in situ dei tessuti e l'NGS sullo stesso strumento. Il sequenziatore spaziale G4X è progettato per offrire nuove funzionalità, flussi di dati impilabili e una produttività senza precedenti per la profilazione spaziale dei tessuti. Le sue nuove capacità includeranno Direct-Seq, che consiste nel sequenziamento di molecole di RNA in situ e ha il potenziale di aprire nuove aree di scoperta scientifica.

Inoltre, il G4X offrirà letture di trascritti mirati, proteine mirate e una colorazione H&E fluorescente, tutto nello stesso campione di tessuto. Infine, questa combinazione di modalità di lettura sarà offerta in una scala senza precedenti. Con 40 cm2 di area di imaging flessibile e tempi di esecuzione di un solo giorno, il sistema G4X consentirà ai laboratori di elaborare 20 volte più campioni alla settimana rispetto alle tecnologie esistenti.

I kit iniziali di G4X supporteranno la trascrizione, la proteomica e offriranno una colorazione H&E fluorescente. Il sistema è progettato per accogliere un gran numero di campioni e per leggere centinaia di target genici e decine di proteine nella stessa sezione di tessuto. I contenuti saranno disponibili in pannelli fissi o personalizzabili per il cliente.

I futuri kit del G4X supporteranno anche Direct-Seq, che è stato progettato per leggere direttamente regioni variabili di RNA, come le mutazioni hotspot del cancro, gli RNA guida negli schermi CRISPR o le sequenze dei recettori delle cellule B e T. La capacità di eseguire il sequenziamento diretto dell'RNA all'interno di cellule e tessuti dovrebbe portare una nuova potente modalità di lettura per la patologia molecolare in situ. Direct-Seq sarà inizialmente disponibile come servizio, con piani per un rilascio più ampio poco dopo.

Singular ha annunciato in precedenza un programma di accesso alla tecnologia per il PX, i cui insegnamenti sono stati applicati allo sviluppo del G4X. Attraverso il suo programma di accesso alla tecnologia, Singular ha collaborato attivamente con istituzioni leader per generare dati sul G4X e dimostrare la sua applicabilità in aree di ricerca critiche. Caratteristiche chiave previste del G4X?

Sequenziatore spaziale: Throughput leader del settore: Si prevede che un'area di imaging di 40 cm2 per corsa attraverso quattro celle di flusso spaziali aumenterà drasticamente la produzione di campioni, pur mantenendo la flessibilità per le corse più piccole. Direct-Seq: sequenziamento in situ dell'RNA, progettato per sequenziare regioni geniche variabili direttamente all'interno di cellule e tessuti, con potenziali applicazioni in immunologia, immuno-oncologia, ricerca sul cancro ed editing genico. Trascritti: Centinaia di trascritti genici, che saranno disponibili in pannelli curati e nella selezione di target genici personalizzati.

Proteine: Decine di proteine, che saranno disponibili in pannelli curati e nella selezione di target proteici personalizzati. H&E fluorescente: macchia H&E fluorescente sovrapposta ai trascritti e alle proteine sullo stesso campione di tessuto. Tempi rapidi: Grazie a un processo di trasferimento dei tessuti specializzato, a un flusso di preparazione dei campioni semplificato e a un sequenziamento ad alta velocità in un solo giorno, gli utenti potranno passare dal campione alla scoperta in soli tre giorni.

Economico: Grazie alla sua capacità di produzione senza precedenti, il G4X ridurrà significativamente il costo per campione a meno della metà rispetto agli approcci alternativi, rendendo più accessibile la multiomica spaziale. Il sistema è quotato a 495.000 dollari, gli aggiornamenti di G4X dovrebbero essere disponibili per i clienti G4 entro la fine del 2024, insieme a un pannello immuno-oncologico iniziale di circa 300 trascritti genici, 10-15 proteine e la possibilità di personalizzare il contenuto. Il rilascio di Direct-Seq e di altri pannelli è previsto in un secondo momento.

Singular prevede anche di fornire servizi di accesso alla tecnologia di sequenziamento spaziale G4X a partire dal secondo trimestre del 2024. L'azienda prevede di condividere ulteriori informazioni e dati in occasione del prossimo incontro generale annuale AGBT a Orlando, in Florida (5-8 febbraio 2024).