NanoString Technologies, Inc. ha annunciato il rilascio del primo set di dati pubblici dell'intero trascrittoma ottenuto con una vera risoluzione monocellulare sull'Imager Molecolare Spaziale CosMx? Spatial Molecular Imager (SMI). I dati saranno presentati alla 42esima conferenza annuale J.P. Morgan Healthcare Conference 2024 a San Francisco, durante la presentazione aziendale di NanoString il 10 gennaio 2024, alle ore 17.15 ET.

Il pannello CosMx Whole Transcriptome raggiunge il traguardo scientifico: NanoString è la prima azienda a raggiungere il traguardo scientifico di fornire un vero e proprio imaging del trascrittoma intero di una singola cellula. Questa pietra miliare tecnologica è stata raggiunta utilizzando la piattaforma CosMx SMI, che consente ai ricercatori di visualizzare simultaneamente l'espressione di tutti i geni codificanti proteine del genoma umano in situ, fornendo la capacità definitiva per la biologia spaziale delle singole cellule. Il pannello CosMx Whole Transcriptome Panel trasforma il potenziale di estrazione delle conoscenze biologiche dai campioni di tessuto FFPE (formalin-fixed paraffin-embedded).

Imaging dell'espressione di quasi 19.000 geni in una sola volta, questo prodotto fornirà una copertura quasi 40 volte superiore a quella dei saggi attualmente commercializzati dalle piattaforme concorrenti. I ricercatori possono ora esplorare milioni di cellule per esperimento, identificare tipi di cellule rare e comprendere le interazioni cellula-cellula nel contesto spaziale, fornendo una comprensione completa dei paesaggi cellulari mai accessibile prima. Queste capacità saranno disponibili a un costo inferiore per singola cellula, fornendo al contempo un throughput cellulare più elevato rispetto al tradizionale sequenziamento dell'RNA di una singola cellula (scRNA-seq). NanoString prevede di lanciare commercialmente il pannello di trascrittomi interi CosMx nel 2025.

NanoString segna questa pietra miliare con il rilascio pubblico di un set di dati del trascrittoma intero CosMx SMI generato da campioni FFPE di tessuto pancreatico umano sano. Questo set di dati, primo nel suo genere, dimostra la biologia funzionale del pancreas, rivelando tipi di cellule rare che in genere vengono perse con i metodi tradizionali di scRNA-seq. Questo set di dati è stato generato utilizzando una versione prototipo del pannello e del relativo software, e si prevede che le prestazioni della nuova funzionalità miglioreranno nella versione commerciale completa, diventando ancora più impressionanti nel tempo.

Prevedendo un intenso interesse da parte della comunità scientifica, NanoString presenterà le funzionalità del Trascrittoma Intero di CosMx SMI durante le presentazioni del prossimo meeting AGBT a Orlando, in Florida, dal 5 all'8 febbraio 2024. I clienti che hanno ottenuto l'accesso ai prototipi del Pannello di Trascrittoma Intero di CosMx presenteranno i set di dati generati sul cancro al pancreas, sul cancro al colon-retto e sul cervello umano.

NanoString è inoltre sulla buona strada per iniziare la spedizione commerciale del pannello CosMx Human 6K Discovery Panel a partire dal primo trimestre del 2024. Questo innovativo pannello, che offre un plex 6 volte superiore rispetto agli attuali pannelli CosMx SMI, consentirà ai ricercatori di approfondire gli stati e le funzioni delle cellule, di esplorare le intricate interazioni cellula-cellula e di fornire nuove conoscenze sulle risposte cellulari spaziali a un livello senza precedenti.