Bruker Corporation ha annunciato i progressi nell'immunopeptidomica, nella glicoproteomica e in altri flussi di lavoro 4D-proteomici abilitati dal CCS. I rapidi progressi nelle soluzioni di ricerca proteomica profonda e su scala, glicomica e peptidomica completano altri strumenti per le scienze della vita leader nelle prestazioni per l'era post-genomica di Bruker. Insieme, consentono di effettuare ricerche di biologia molecolare e cellulare post-genomica, con approfondimenti chiave sulla biologia delle malattie e sui biomarcatori per la diagnostica molecolare di prossima generazione e la scoperta di farmaci.

I progressi presentati a US HUPO includono un sequenziamento de novo con machine-learning migliorato (Novor V2.0), un nuovo software di monitoraggio ad alte prestazioni digital-twin (TwinScape), il nuovo metodo glyco-PASEF per l'analisi dei glicopeptidi ad alta sensibilità e l'accesso a Spectronaut 18 per gli utenti di BrukerProteoScape, un software alimentato da GPU per la proteomica 4D in tempo reale, ora con accesso alle ricerche senza librerie di Biognosys directDIA. A. Avanzamento della ricerca sull'immunoterapia del cancro: Bruker migliora i suoi sistemi timsTOF HT e timsTOF Ultra con il nuovo software Novor v2.0 per la profilazione immunopeptidica de novo. Novor v2.0, sviluppato in collaborazione con Rapid Novor Inc. è stato addestrato su >1.400.000 spettri che corrispondono a >150.000 peptidi HLA per la ricerca su piccole quantità di materiale del paziente derivato da biopsie ad ago sottile.

B. Prestazioni timsTOF di picco con TwinScape: TwinScape è un nuovo motore digitale di monitoraggio delle prestazioni e di controllo della qualità, che sfrutta gli standard peptidici iRT per supportare prestazioni di picco sostenute nella preparazione dei campioni e nella LC-MS. Per gli studi multiomici sinergici nell'era post-genomica, è necessaria una combinazione di profondità di copertura, robustezza e quantificazione scalabile. TwinScape consente studi controllati più ampi e una valida comparabilità tra laboratori. C. Nuovo Glyco-PASEF per l'analisi 4D dei glicopeptidi ad altissima sensibilità: Bruker presenta il nuovo metodo timsTOF glyco-PASEF con filtraggio poligonale sviluppato con il Gruppo Heck dell'Università di Utrecht, il software GlycoScape sviluppato in collaborazione con il Gruppo Van Gool dell'Università di Radboud e il software MSFragger-Glyco sviluppato dal Gruppo Nesvizhskii dell'Università del Michigan.

D. Progressi del software per dia-PASEF: L'ultima release di Bruker ProteoScape rende disponibile un modulo Spectronaut 18 per l'analisi dia-PASEF, consentendo di ottenere risultati in tempo reale utilizzando l'elaborazione su GPU, incluso directDIA per ricerche senza librerie. Bruker ProteoScape aggiorna anche il software TIMS DIA-NN alla versione 3.0, con una migliore precisione di quantificazione.