Alla US HUPO, Bruker Corporation ha annunciato il suo software TIMS DIA-NN per il flusso di lavoro della proteomica 4D ad alta produttività, profondo e imparziale. Ora è dotato del nuovo algoritmo TIMScore che sfrutta l'apprendimento automatico per prevedere i valori CCS dei peptidi tripticati e fosforilati. Con TIMScore, i valori CCS misurati vengono confrontati con i valori CCS previsti all'interno dello spazio di ricerca per chiamare l'assegnazione più probabile, anche quando gli algoritmi di ricerca tradizionali non sono in grado di assegnare una corrispondenza spettrale del peptide a causa dell'ambiguità derivante dal basso segnale-rumore o dalle interferenze chimeriche. Queste caratteristiche sono ora disponibili nella release del software PaSER 2022 basata su GPU, che si basa sulle risorse del software IP2 acquisite nel 2021. PaSER 2022 include l'algoritmo TIMScore e TIMS DIA-NN per l'elaborazione dei flussi di lavoro dia-PASEF dai sistemi timsTOF Pro 2, timsTOF SCP e timsTOF fleX. PaSER utilizza gli stessi meccanismi di streaming dei dati per i flussi di lavoro dia-PASEF in MS in tempo reale, consentendo l'attivazione della ricerca della libreria spettrale alla fine della corsa di acquisizione, supportando ‘Run and Done’ per flussi di lavoro proteomici 4D ad alta produttività.