Seer Inc. ha annunciato un nuovo flusso di lavoro di proteogenomica che integra la proteomica profonda e imparziale con la genomica, grazie alla Proteograph Analysis Suite 2.0, la suite software di Seer per l'analisi dei dati e la visualizzazione dei risultati. Il rilascio del flusso di lavoro segna un'altra pietra miliare nel percorso di Seer per consentire una proteogenomica accurata, ad alta risoluzione e a livello di peptidi, su scala, e segue la formazione del suo Consorzio di Proteogenomica nella prima metà di quest'anno. Capire la connessione tra i geni e le proteine a livello di sequenza peptidica è necessario per comprendere la salute e la malattia umana, guidare la scoperta di biomarcatori e consentire lo sviluppo di nuove terapie.

Le proteine dettano la risposta fisiologica dell'organismo alle malattie e sono a loro volta influenzate dallo stato di malattia. Un singolo gene in genere dà origine a più varianti proteiche, come le varianti di splice, che possono avere ruoli fisiologici distinti e un impatto sulla biologia. Ogni variante proteica dà origine a un profilo diverso di peptidi, che la Suite di Prodotti Proteograph può identificare e quantificare, risolvendo le varianti proteiche note e nuove a livello di peptidi.

Gli attuali approcci basati sull'affinità rilevano i cambiamenti per una serie di target proteici predefiniti, mancando varianti potenzialmente importanti di queste proteine predefinite e fornendo una visione incompleta della relazione tra il genoma e il proteoma. La Proteograph Analysis Suite 2.0 di Seer è un componente chiave della Proteograph™ Product Suite, che fornisce una proteomica rapida, profonda e imparziale su scala, centrata sui peptidi, e consente l'identificazione ad alta risoluzione delle varianti proteiche. La prossima versione della Suite di Analisi Proteograph incorpora un Flusso di Lavoro Proteogenomico che mappa i dati proteomici, a livello di peptidi, con i dati genomici per identificare i peptidi di varianti specifiche del campione non catturati nei database di riferimento canonici.

Il flusso di lavoro riassume i risultati in tabelle e grafici interattivi, consente di visualizzare la relazione dei peptidi identificati con la struttura del gene, le informazioni sul dominio proteico e le regioni funzionali; e crea mappe di dati peptidici navigabili a livello di aminoacidi. Le visualizzazioni intuitive di Proteograph Analysis Suite rendono più facile e veloce la scoperta di target proteici per un'ampia gamma di applicazioni. Il lancio del Flusso di Lavoro Proteogenomico rafforza l'impegno di Seer nel consentire un accesso più ampio agli strumenti proteogenomici.

A gennaio, Seer ha costituito il Consorzio Proteogenomica con Discovery Life Sciences, leader globale nello sviluppo di biomarcatori e soluzioni biospecifiche che utilizzano tecnologie proteomiche, genomiche, cellulari e di immunoistochimica, e SCIEX, leader globale nelle tecnologie analitiche per le scienze della vita. La collaborazione intende consentire ai clienti della genomica di aggiungere più facilmente ai loro studi dati proteomici profondi e imparziali, consentendo la scoperta di nuove varianti proteiche e di nuovi biomarcatori che potrebbero portare a scoperte terapeutiche.