Badie è stato eletto nel 2010 come ottava 'guida generale' dell'organizzazione, che un tempo era il movimento islamista più grande e più influente del Medio Oriente, solo un anno prima delle rivolte della Primavera Araba.

Ha iniziato ad attirare paragoni con la guida suprema iraniana, l'Ayatollah Ali Khamenei, dopo aver guidato la Fratellanza verso una maggioranza parlamentare attraverso la sua ala politica fondata per la prima volta durante il suo regno, il Partito Libertà e Giustizia (FJP), e l'ascesa dell'ex Presidente egiziano Mohamed Mursi come primo capo di Stato democraticamente eletto nella storia moderna dell'Egitto.

Badie, 81 anni, è nato nella città industriale del Cairo di

El-Mahalla El-Kubra, una città operaia politicamente attiva che in seguito ha assistito alle proteste contro Mursi.

Si è laureato presso la scuola di veterinaria dell'Università del Cairo, dove si è unito per la prima volta alla Fratellanza e ha conseguito il dottorato di ricerca. In seguito ha lavorato come professore all'Università di Beni-Suef.

È stato imprigionato diverse volte nel corso della sua vita, la prima delle quali dopo una condanna a 15 anni in un caso militare nel 1965 che ha visto l'esecuzione del luminare della Fratellanza Sayyid Qutb, i cui scritti rivoluzionari islamisti hanno fornito carburante ideologico per la militanza in Egitto e oltre per decenni.

Qutb, che è stato citato come una grande influenza su Badie, è stato condannato con l'accusa di aver cercato di rovesciare lo Stato dell'ex Presidente socialista Gamal Abdel Nasser. Badie ha scontato solo nove anni dei quindici previsti.

Badie è stato imprigionato in altri due casi militari durante il regno di Mubarak, prima di essere condannato all'ergastolo in almeno tre casi dopo essere stato condannato per il suo ruolo nelle violenze scoppiate dopo che l'esercito, guidato dall'allora Generale Abdel Fattah al-Sisi, ha rovesciato Mursi in seguito a manifestazioni di massa contro di lui.

Ha rischiato una condanna a morte in un altro caso, in quello che i gruppi per i diritti definiscono un giro di vite senza precedenti da parte del governo dell'attuale Presidente Sisi, che durante la campagna elettorale per la presidenza ha promesso di eliminare la Fratellanza. L'unico figlio di Badie, Ammar, è stato ucciso durante lo sgombero delle proteste da parte dell'esercito nel 2013.

"Non c'è una sola prova legale valida per qualsiasi accusa mossa contro di me", ha dichiarato Badie a un tribunale che supervisiona il caso della "dispersione del sit-in di Rabaa" contro di lui nel 2016.

La Fratellanza e i suoi sostenitori si sono accampati per settimane nelle strade intorno a Piazza Rabaa al-Adawiya al Cairo, dove i gruppi per i diritti affermano che più di 800 persone sono state uccise quando le forze di sicurezza hanno fatto irruzione per sgomberarla.

Sotto Badie, un islamista integralista, la Fratellanza immaginava l'Egitto come un baluardo nel tentativo di islamizzare il Medio Oriente. Voleva fare dell'Egitto, il più grande Stato della regione con il più grande esercito, un modello di società islamica. Il problema è stato che i musulmani egiziani si sono sentiti trattati con condiscendenza dai tentativi della Fratellanza di spiegare loro il modo migliore per essere musulmani, il che ha portato a proteste di massa contro di essa.

Badie ha attirato ampie critiche quando è stato visto come il governatore de-facto dell'Egitto, molti hanno denunciato la sua influenza dominante che ha messo in ombra Mursi. Un sistema di governo sunnita che assomiglia in modo allarmante all'Iran sciita, dove un leader islamista diventa il riferimento di governo di un presidente democraticamente eletto, è stato ampiamente disapprovato in Egitto.

Pubblicamente, la Fratellanza ha respinto tali critiche e Badie ha negato tale influenza.

"Il Presidente Mursi è il vero Presidente dell'Egitto e non accetto di interferire in alcun modo nel suo lavoro, né di fare da tramite con il Presidente per nessuno", ha detto Badie in un'intervista ad Asharq Al-Awsat nel 2012.

"Il Presidente (Mursi) è ora il Presidente di tutti gli egiziani e si è dimesso da tutte le posizioni di leadership all'interno dei Fratelli Musulmani e del partito (Libertà e Giustizia). Quindi non dobbiamo cercare di creare ostacoli alla marcia, perché non possiamo costruire nulla stimolando tali questioni", ha aggiunto Badie.

L'esercito ha detto di essere stato costretto a intervenire nel 2013 da una rivolta popolare contro il governo partigiano della Fratellanza. Badie e Mursi, che è morto nel 2019 dopo essere crollato in un tribunale del Cairo mentre era sotto processo con l'accusa di spionaggio, sono stati messi in prigione insieme a molte figure di spicco della Fratellanza e a centinaia di loro sostenitori.

"Anche se mi giustiziassero mille volte, non mi allontanerei dalla retta via", ha dichiarato Badie nel 2014, citato dall'avvocato Osama Mursi, figlio di Mohamed Mursi, che ha assistito a uno dei suoi processi al Cairo.