Bionano Genomics, Inc. ha annunciato il lancio di diversi nuovi prodotti e progressi per il suo flusso di lavoro di mappatura ottica del genoma, che offrono una maggiore robustezza nella preparazione dei campioni, una riduzione dei tempi di esecuzione per l'etichettatura e l'imaging del DNA e miglioramenti nella produttività e nelle metriche di qualità. Le nuove versioni dei kit di preparazione dei campioni, dei chip e del software dello strumento di Bionano rispondono al feedback dei clienti e possono migliorare le prestazioni nelle applicazioni di routine di analisi del genoma a volume elevato. I kit di preparazione dei campioni di Bionano sono utilizzati per estrarre ed etichettare il DNA ad altissimo peso molecolare (UHMW) da utilizzare sul sistema Saphyr.

Questi kit sono ottimizzati per eseguire le applicazioni OGM di Bionano su una varietà di tipi di campioni. I kit della Generazione 2 supporteranno campioni di sangue, linee cellulari e aspirati di midollo osseo, con versioni per campioni di tessuto e di tumore previste più avanti nel 2023. Anche i kit Bionano Prep SP-G2 (SP-G2) e Bionano Prep Direct Label and Stain (DLS-G2) sono aumentati di dimensioni, passando da kit a 10 reazioni a kit a 12 reazioni, un aggiornamento che si adatta meglio ai materiali di consumo dei chip dell'azienda.

Il kit SP-G2 migliora l'isolamento del DNA UHMW e consente tassi di successo dei campioni più elevati, meno errori da parte dell'utente e più dati generati per ogni corsa. Uno dei principali miglioramenti nella preparazione dei campioni è la possibilità di isolare il DNA di qualità superiore, soprattutto per i campioni marginali. Il nuovo protocollo può anche eliminare i vincoli di tempo e di processo, rendendo la fase di lisi più facile da usare e meglio ottimizzata per le corse con diversi tipi di campioni, il che consente agli utenti di batchare fino a sei campioni contemporaneamente.

Questi miglioramenti nella chimica possono portare, in ultima analisi, ad un aumento della produzione di DNA, per un maggior numero di dati generati per ogni corsa di campione. Inoltre, un derivato del kit SP-G2 supporta l'isolamento automatico del DNA UHMW Long String Vantage di Hamilton. Il kit DLS-G2 di Bionano consente di completare l'etichettatura in sole cinque ore, per caricare il DNA etichettato sullo strumento Saphyr in giornata.

Questa chimica migliorata può consentire una riduzione complessiva del tempo di turnaround (o dal campione alla risposta) e rendere possibile ottenere risposte ad alta profondità per i campioni di cancro in soli tre giorni. Bionano ha aumentato la stabilità dei reagenti da nove mesi a un anno per il kit DLS-G2, per essere coerente con il kit SP-G2, il che può tradursi in un minor spreco di reagenti e in una maggiore utilità per un periodo di tempo più lungo. Il Saphyr Chip G3.3, una nuova versione del software di controllo dello strumento (ICS v5.3) e una nuova versione di Bionano Access (v.1.7.2), consentono di migliorare il rendimento e i tassi di successo quando due Saphyr Chip vengono caricati in parallelo, permettendo di elaborare da tre a sei campioni in più per settimana lavorativa.

Questi miglioramenti della produttività derivano da una riduzione dell'evaporazione dei campioni e aumentano l'affidabilità del caricamento dei campioni e delle prestazioni sullo strumento Saphyr. Una maggiore produttività si traduce anche in migliori rendimenti di primo passaggio e può eliminare il rischio di esaurimento del campione quando si lavora con campioni complessi e con tempi di scansione più lunghi, come quelli della ricerca sul cancro o del bioprocesso cellulare. Il supporto ICS v5.3 per il Saphyr Chip G3.3 migliora la coerenza del rendimento tra le varie corse e la robustezza dell'allineamento.